Body fluid나 swab과 같은 host sample에서 microbiome 연구시, Host DNA contamination은 microbiome에 대한 분자생물학적 분석에 방해요인으로 작용하게 됩니다. SPINeasy™ Host Depletion Microbial DNA kit는 많은 양의 host DNA가 포함된 샘플에서 microbial DNA를 선택적으로 추출하기 위한 고안된 제품입니다. Kit에 포함되어 있는 Host Lysis buffer를 이용하여, host cell 만 선택적으로 lysis, Host DNA를 용액으로 release 시킨 후 원심분리를 통해 host DNA를 제거합니다. 남아있는 host DNA와 dead microbial cell의 DNA는효소를 이용한 분해를 통해 완전히 제거됩니다. Intact microbial cell은 특화된 버퍼와 MP biomedicals 의 Fastprep® bead homogenizer와 같은 비드 호모게나이저를 사용하여 lysis 후 silica-membrane spin-column technology를 사용하여 Microbial DNA를 정제하면 됩니다. 이렇게 추출된 DNA는 downstream application에 바로 사용 가능합니다.

Kit 성능

아래는 saliva 샘플에서 SPINeasy™ Host Depletion Microbial DNA Kit를 이용하여 DNA를 추출한 후 PCR을 진행한 데이터로 효율적인 host DNA depletion과 microbial DNA recovery 결과를 보실 수 있습니다. Host DNA depletion과 bacteria DNA 회수율은 qPCR 분석을 통해 모두 90% 이상인 것으로 추정됩니다.

그림 1: saliva 샘플에서 SPINeasy™ Host Depletion Microbial DNA Kit를 이용하여 DNA를 추출한 후 PCR을 진행 a) human β-globin primer를 사용하여 host DNA의 PCR detection. b) 16S primer를 사용하여 bacterial DNA의 PCR detection. M: DNA marker; Lane 1, 3, 5: host depletion steps 없이 total DNA 추출; Lane 2, 4, 6: SPINeasy™ Host Depletion Microbial DNA Kit를 사용하여 host depletion된 (H. dep) DNA; Lane 7: PCR negative control.

여기에서 SPINeasy™ Host Depletion Microbial DNA 샘플 (SKU:116545000/ 5 Preps)을 신청하세요.

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Application Notes

SPINeasy™ Host Depletion Microbial DNA kit는 많은 양의 host DNA가 포함된 샘플에서 microbial DNA를 선택적으로 추출 할 수 있는 편리한 핵산추출 키트 입니다.

Key Applications

유전학; 분자생물학

Specifications

SKU	116545050
Alternate Names	SPINeasy Host Depletion Microbial DNA Kit; Host DNA Depletion Kit
Application Notes	SPINeasy™ Host Depletion Microbial DNA kit는 많은 양의 host DNA가 포함된 샘플에서 microbial DNA를 선택적으로 추출 할 수 있는 편리한 핵산추출 키트 입니다.
Base Catalog Number	65450
Product Line	SPINeasy
Components	12 mL Equilibration buffer,50x Lysing Matrix E, 60 mL Host Lysis Buffer, 6 mL Host Depletion Buffer, 1 Vial Host Depletion Enzyme HDE, 200 µL HDE Reconstitution Buffer, 12 mL Microbial Selection Buffer, 40 mL Microbial Lysis Buffer, 30 mL Wash Buffer HD1, 6 mL Wash Buffer HD2, 6 mL Wash Buffer HD, 50x Column HD with collection tubes
Format	Kit
Pack Size	50 Preps
Sample Type	Saliva, Bacteria (Gram +/-), Swabs, Bodily Fluid
Storage	Store at Room Temperature (15-25℃) in a dry environment