SPINeasy® 96-Well DNA Pro Kit for Soil

SPINeasy 96-Well DNA Pro Kit for Soil은 다양한 종류의 토양 샘플에서 DNA를 추출 할 수 있도록 고안된 제품입니다. 이 키트는 미생물 함량이 많거나 적은 샘플 모두에서 효과적으로 핵산을 추출할 수 있으며, 다양한 유형의 토양샘플도 적용 가능합니다. SPINeasy 96-well DNA Pro Kit for Soil로 추출한 DNA는 타사 A사 & B사의 결과와 비교해 볼 때 일관되게 높은 수율과 순도를 얻을 수 있었습니다(그림1. 위). 추출된 DNA는 Agilent Tapestation 4150을 사용하여 integrity와 수율을 분석하였으며, DNA integrity (DIN) 값은 세 종류의 키트 모두에서 유사하였으나, virtual gel 상에서는 SPINeasy 로 추출한 경우가 가장 수율이 높은 것을 확인할 수 있었습니다 (그림 1, 아래)

그림 1. DNA Quality (위). SPINeasy 96-Well DNA Pro Kit for Soil과 타사 키트를 사용하여 추출한 gDNA의 agarose gel 전기영동 결과. 각 추출된 DNA 수율과 순도(A260/280 및 A260/230)는 spectrophotometer를 사용하여 측정되었습니다. 각 점은 단일 추출을 나타내며, 가로 막대는 중간 값을 나타냅니다. (아래). Agilent 4150 TapeStation 분석을 통해 얻은 Virtual gels과 DNA integrity (DIN) 값. 다양한 biomass level을 가진 토양 샘플(각 250mg)을 SPINeasy 96-Well DNA Pro Kit for Soil, 타사 A 및 B 키트를 사용하여 실험 진행되었습니다. 

Humic acid로 심하게 오염된 토양에서 SPINeasy 96-Well DNA Pro Kit for Soil을 사용하여 추출한 genomic DNA는 quantitative PCR(qPCR)에 바로 사용할 수 있었으며, inhibition은 관찰되지 않았습니다(그림 2). 이는 이 키트가 PCR inhibitors를 효과적으로 제거함을 의미합니다. SPINeasy 96-Well DNA Pro Kit for Soil을 사용하여 추출한 gDNA의 qPCR 결과는 타사제품 보다 낮은 CT 값을 보였습니다(그림 2).

그림 2.  Amplifiability. SPINeasy 96-Well DNA Pro Kit for Soil과 타사 키트를 사용하여 세종류의 토양 샘플에서 추출한 gDNA의 qPCR 증폭 데이터.  DNA template양: 50ng. Primers: 16S rRNA(197bp). Inhibitor-sensitive quantitative PCR을 사용하여 희석하지 않은 샘플에서 inhibitor의 존재여부를 평가했습니다. SPINeasy 96-Well DNA Pro Kit for Soil 및 타사 키트를 사용하여 High Biomass soil sample에서 추출한 gDNA를 사용하여 bacteria 16S rRNA 유전자를 증폭했습니다. SPINeasy 96-Well DNA Pro Kit for Soil로 추출한 gDNA는 downstream applications (예: qPCR)에 성공적으로 사용될 수 있었으며, 이것으로 이 키트가 inhibitor를 효과적으로 제거함을 입증하였습니다.

 

Application Notes

SPINeasy® 96 Well DNA Pro Kit for Soil은 low biomass 샘플이나 높은 오염 수준을 가진 까다로운 토양 유형에서도 효율적으로 DNA를 추출할 수 있으며, 96well 타입으로 대량 샘플 처리가 가능합니다.

Usage Statement

Research Use Only (RUO)

Key Applications

PCR, qPCR amplification