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SPINeasy™ DNA Kit for Soil, 50 preps of nucleic acid isolation

SPINeasy™ DNA Kit for Soil, 50 preps of nucleic acid isolation

Key features and details

Spin-column 테크놀로지를 활용한 고성능 토양 genomic DNA 추출 키트

 

무료로 사용해보세요:

 

SKU: 116530050

Packaging size:
50 preps
Product Description

SPINeasy™ DNA Kit for Soil은 spin-column 테크놀로지를 활용한 고성능의 genomic DNA 추출 키트로, 토양으로 부터 약 30분 이내 genomic DNA 추출이 가능합니다. 실험 방법은 키트내 포함되어 있는 Lysing Matrix E tube에 토양샘플을 넣고 FastPrep® 혹은 동급의 비드 호모게나이저를 통해 bacteria, fungi, virus, protist 등의 다양한 세포들을 효율적으로 lysis 하게 됩니다.

Column S1은 높은 binding capacity를 가지고 있어, 고농도의 genomic DNA분리가 가능하며, 최적화된 buffer들은 PCR inhibitor로 작용하는 humic substance와 그 외 contaminant들을 효율적으로 제거하여, 어떤 까다로운 환경샘플에서도 고농도, 고순도의 genomic DNA 추출을 가능하게 합니다.

추출된 genomic DNA는 PCR, 제한효소 반응, 시퀀싱 등의 다양한 downstream analysis에 바로 사용 가능합니다.

SPINeasy™ DNA Kit for Soil의 장점

고순도의 genomic DNA 추출 가능

SPINeasy™ DNA Kit for Soil은 다양한 토양 타입에서 사용 가능하며, 추출된 genomic DNA는 높은 순도를 가집니다.

아래 실험데이터에서 보는 바와 같이, SPINeasy™ DNA Kit for Soil 로 추출한 genomic DNA 는 타사제품에 비해 다양한 토양 타입에서 높은 순도를 보여주었습니다. DNA 의 순도는 흡광도 측정을 통해 260nm와 280nm (A260/A280)의 비율로 계산하였으며, 일반적으로 A260/A280의 비율이 1.8-2.0 사이에 있는 경우 순도가 좋은 것으로 판단합니다. A260/A280의 비율이 2.0 보다 큰 경우 RNA의 contamination을 생각해 볼 수 있습니다.

 

DNA extraction Purity_260280_1280px Remark 2: Pure DNA has 260/230 > 1.00.

설명1: 다양한 샘플에서 추출된 genomic DNA의 순도 (A260/A280)비교: SPINeasy™ DNA Kit for Soil (파란색 막대)로 추출한 DNA가 모든 토양 샘플 타입에서 타사제품들과 비교해 볼 때 가장 일관되게 높은 순도를 보여주는 유일한 키트였습니다.

추출한 DNA 의 contaminant 함유 여부는 앞에 서와 비슷하게 흡광도 260nm 와 230nm 의 비율의 값으로 계산될 수 있습니다. 230nm에서 흡광도 값이 높게 나오는 것은 organic compound나 chaotropic salt 등이 추출한 DNA 용액내에 존재하는 것을 의미합니다. 즉, A260/A230 비율은 추출한 DNA 에서 salt 성분의 carryover 수준을 평가하는데 도움이 될 수 있습니다. 예를 들어 이 비율이 낮은 경우, 추출한 DNA 내에 humic acid와 같은 샘플자체가 가지고 있는 contaminant 또는 추출과정에 사용되는 Guanidine Thiocyanate (GTC) 등이 포함되어 있을 수 있습니다. 일반적으로 A260/A230 비율이 1 또는 그 이상인 경우 핵산의 순도가 높고, contaminant가 없는 것으로 간주합니다.

DNA extraction Purity_260230_1280pxRemark 1: Pure DNA has 260/280 at 1.80 (Indicated with red line).

설명 2: 다양한 샘플에서 추출된 genomic DNA의 순도 (A260/A230) 비교: SPINeasy™ DNA Kit for Soil로 추출된 DNA (파란색 막대)는 모든 토양 샘플 타입에서 A260/A230 값이 1 이상으로 contaminant가 포함되지 않았음이 확인되었습니다.

 추출한 genomic DNA의 높은 수율과 integrity

SPINeasy™ DNA Kit for Soil은 타사제품에 비해 일관되게 고농도, 고품질의 DNA 추출이 가능하였습니다. 총 수율은 DNA 농도에 정제한 샘플 양을 곱하여 계산하였으며, integrity는 전기영동 후 band 패턴을 통해 smearing이나 shearing없이 온전한 형태임을 확인하였습니다.

DNA extraction Yield_shearing_1080px

M: DNA Marker;

1-5: Organic soil, paddy soil, flowerbed soil, saline soil, desert soil. SPINeasy DNA Kit for Soil from MP Biomedicals;

6-10:Organic soil, paddy soil, flowerbed soil, saline soil, desert soil. Competitor Kit 1;

11-15: Organic soil, paddy soil, flowerbed soil, saline soil, desert soil. Competitor Kit 2.

 

DNA-extraction-Yield_ngmg_1280px

설명 3: 다양한 샘플에서 추출된 genomic DNA의 수율과 integrity 비교:  SPINeasy™ DNA kit for Soil은 다양한 샘플 타입에서 타사대비 높은 수율과 integrity를 가지는 것을 확인할 수 있었습니다.

 

 

 

 

웨비나: Optimizing Microbiome Research

마이크로바이옴은 토양, 물, 대기 뿐 아니라 우리의 피부와 소화기관까지, 말 그대로 지구 어느곳에서나 존재하고 있습니다. 마이크로바이옴에 대한 연구는 그들이 살고 있는 환경이 어떻게 역할을 하고 있는지에 대한 통찰력을 제공하며, 이것은 토양의 비옥화, 오염 정화, 장의 건강과 질병 치료 등 다양한 분야에 적용될 수 있습니다. 이번 웨비나에서는 마이크로바이옴 연구의 기초와 마이크로바이옴 샘플 준비과정 및 환경 DNA 추출분야의 gold standard provider, MP Biomedicals의 역할에 대해 소개 드리고자 합니다.

 
 

Application Notes

유기 토양(organic soil), 논 토양(paddy soil), 화단 토양(flowerbed soil), 염류 토양(saline soil), 사막 토양(desert soil) 등 다양한 토양 유형에서 고순도 genomic DNA를 고농도로 추출할 수 있습니다. 추출된 genomic DNA는 inhibitor를 함유하지 않으며, PCR, 제한효소 반응, 시퀀싱 등 downstream analyses등에 바로 사용 가능합니다.

Usage Statement

Research Use Only (RUO)

Key Applications

Genomic Research, 환경관련 연구

Specifications
SKU 116530050
Application Notes 유기 토양(organic soil), 논 토양(paddy soil), 화단 토양(flowerbed soil), 염류 토양(saline soil), 사막 토양(desert soil) 등 다양한 토양 유형에서 고순도 genomic DNA를 고농도로 추출할 수 있습니다. 추출된 genomic DNA는 inhibitor를 함유하지 않으며, PCR, 제한효소 반응, 시퀀싱 등 downstream analyses등에 바로 사용 가능합니다.
Base Catalog Number 6530050
Components 50 x 2 mL Lysing Matrix E, 60 mL Lysis Buffer S1, 8 mL Lysis Buffer S2, 550 uL RNase A solution, 15 mL Inhibitor Removal S, 15 mL Binding Buffer S, 6 mL Wash Buffer S, 10 mL DES Buffer, 50 x 2.0 mL Collection Tubes and 50 x 1.5 mL Collection Tubes.
Pack Size 50 preps
Personal Protective Equipment Safety goggles/ faceshield, gloves
Storage Store in a dry environment at room temperature (15-30 °C)
Usage Statement Research Use Only (RUO)
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